一，变黑是因为沙子底部缺氧，造成沉积物无法分解，以及形成的厌氧菌落。

用管子抽出来洗干净（注意不要进去捞），或者直接用洗砂器。放一些爱翻砂的生物，比如鼠鱼、鳅类、马来螺。

二，鱼缸可以做成底部过滤系统，方法是在缸的底部放一层缕空板，铺上7至8毫米厚砂子，水从缸的底部抽出再泵回水体来完成过滤，或泵入上部水槽完成二次过滤。

三，也可以利用缸外式过滤器替代水泵达到二次过滤的目的，这样既增大了过滤面积、提高了过滤效率还可以将下沉至底砂的固体渣子抽到过滤机内进入上部过滤水槽或缸外过滤机，在清洗滤材时去除。由于底砂的沉积物不断得到清理，而且有新鲜的空气进入，对水草生长也十分有利。利用缸外过滤器是一种很好的过滤方式，常用于生态水族缸。如过建立了这样的过滤系统，再栽种大量水草，即使底砂中沉积了鱼类的固体排析物，也无关紧要，由于渣子可以被分解，足可保持水体清澈。